Terletak disebuah wilayah Kabupaten Batang bagian timur yang sebagian besar masyarakat Jawa mengenal dengan istilah Alas Roban. Tepatnya di Desa Banyuputih Kecamatan Limpung, oleh beberapa tokoh Nahdlatul Ulama Kecamatan Limpung (orde sekarang menyebut dengan istilah pemerhati pendidikan) yang berkeinginan untuk memajukan pendidikan di wilayah Kecamatan Limpung, didirikan sebuah sekolah bernuansa Islami dengan nama Madrasah Aliyah Nahdlatul Ulama (MANU) Limpung.
Tahun 1985, dengan “dimandegani” K.H. Sya’ir (Alm) yang pada waktu itu menjabat sebagai Rois Syuriyah MWC NU Limpung dengan dibantu H. Mahfudz (Ketua), H. Zamahsari Sj (Wakil ketua), Ali Sodiqin (Sekretaris), Amin Syafi’i (Wakil sekretaris), Mukhlis AS, Ridwan, K Kusnaini Yasin, Munadjat, Madrasah Aliyah NU Limpung lahir sebagai pioner pendidikan Islam modern di Kecamatan Limpung.
Pendirian Madrasah Aliyah NU Limpung setingkat dengan SLTA ini dimulai dari bangunan sederhana diatas tanah wakaf seorang dermawan seluas 90 m2 di Desa Banyuputih yang secara geografis berjarak 10 KM dari pusat kota Kecamatan Limpung. Jika ditinjau dengan kacamata sederhana, posisi MANU Limpung yang terletak jauh dari pusat kota kecamatan Limpung bisa dikatakan unik. Apalagi jika ditelusuri lebih lanjut bahwa jarak antara MANU Limpung dengan Lokalisasi/Prostitusi besar di Kabupaten Batang tidak lebih dari 1 KM. Fenomena ini seperti “Berlian ditengah lumpur Lapindo”. Namun inilah fakta unik yang ditampilkan oleh para pendirinya yang sebagian besar diyakini memiliki kemampuan spiritual diatas manusia umum.
Selanjutnya pada tahun 1987 secara resmi Madrasah Aliyah NU Limpung, sebuah lembaga pendidikan di bawah koordinasi Lembaga Pendidikan Ma’arif NU Kecamatan Limpung Kabupaten Batang Propinsi Jawa Tengah dan berstatus TERDAFTAR pada Kantor Departemen Agama dan Piagam Nomor : Wk/5.d/153/pgm/MA/1987.
Sebagai bentuk pendidikan formal yang mempunyai komitmen terhadap pengembangan ilmu pengetahuan, Madrasah Aliyah NU Limpung mempunyai visi Terwujudnya manusia yang bertaqwa, cerdas, terampil dan berakhlakul karimah. Visi tersebut mencerminkan bahwa Madrasah Aliyah NU Limpung bertekad untuk turut andil dalam pengembangan ilmu pengetahuan yang tercermin dalam semangat keseimbangan antara ilmu-ilmu agama dalam kerangka membentuk sikap, perilaku dasar manusia terdidik yang dilingkupi dengan kecerdasan dan keterampilan yang mampu menjawab tantangan zaman. Dengan kata lain, MANU Limpung didirikan sebagai benteng terakhir untuk membentuk remaja/manusia modern yang tidak meninggalkan nilai-nilai kehidupan Islami.
Pada perkembangannya dengan Surat Keputusan Dirjen Binbaga Islam Departemen Agama RI Nomor : 71/E.IV/PP.03.2/KEP/XII/95 Madrasah Aliyah NU Limpung berubah status menjadi DIAKUI dan pada tahun 2000 dengan SK Nomor : 71/E.IV/PP.03.2/KEP/56/2000 statusnya menjadi DISAMAKAN. Disamping itu, MANU Limpung merupakan satu-satunya sekolah yang mempunyai program studi bahasa, disamping program studi yang lain seperti IPS dan IPA, oleh karena itu, MANU Limpung semakin bersemangat untuk memperluas pengaruh pendidikan Islam di Kecamatan Limpung dengan jalan mendirikan MANU Limpung Kampus 2 di pusat kecamatan Limpung. Tepatnya Desa Babadan Kecamatan Limpung.
Pada tahun 2005 berdasarkan hasil akreditasi madrasah yang dilakukan oleh Dewan Akreditasi Madrasah Provinsi Jawa Tengah maka Madrasah Aliyah NU Limpung dinyatakan sebagai madrasah TERAKREDITAS A (Sangat Baik) dengan Piagam Akreditasi Madrasah Aliyah Nomor Kw.11.4/4/PP.03.2/625.25.03/2005. Konsekuensi logisnya adalah MANU Limpung ditunjuk sebagai Madrasah Pembina bagi Madrasah Aliyah Swasta di wilayah Kabupaten Batang.
Dengan posisinya yang telah kuat namun tetap berkeinginan untuk meningkatkan kualitas pendidikan masyarakat Kecamatan Limpung, MANU Limpung memberanikan diri untuk melahirkan sekolah-sekolah baru dalam rangka memfasilitasi pencapaian kualitas SDM di wilayah Kecamatan Limpung.
Berdasarkan fenomena kebijakan pemerintah untuk menghidupkan sekolah kejuruan yang siap menciptakan tenaga teknis/trampil, tepatnya tahun 2003 MANU Limpung berinisiatif untuk mendirikan sebuah sekolah menengah kejuruan dengan nama SMK NU Limpung yang sampai sekarang telah memiliki Program Studi Akuntansi dan Manajemen Penjualan. Adapun letak SMK NU Limpung ini berada tepat disebelah barat Terminal Limpung dan pada tahun 2008, MANU Limpung kembali memperluas bidang pendidikan dengan cara mendirikan sekolah kejuruan yang berada di wilayah kecamatan Banyuputih (perlu diketahui, pada tahun 2007 berdiri kecamatan baru yaitu Kecamatan Banyuputih) dengan nama SMK Diponegoro. Sekolah kejuruan yang memiliki paradigma “menciptakan teknisi muda komputer yang berwawasan islami” ini memiliki Program Studi Teknik Informasi dan Komunikasi dengan Program Keahlian Teknik Komputer dan Jaringan.
MANU Limpung yang saat ini dipimpin oleh Bapak Ali Sodiqin, B.A didukung oleh 40 guru muda (2 diantaranya adalah PNS) selalu berusaha mensejajarkan diri dengan sekolah negeri di Kabupaten Batang. Pada tahun 2006 dan 2007, ketika pemerintah menaikkan standar kelulusan untuk ujian nasional, hampir seluruh siswa SLTA/MA, guru, wali murid yang anaknya sedang duduk di kelas 3 sedang mengalami stress akut karena ketakutan peluang kelulusannya rendah, tapi MANU Limpung justru sanggup menciptakan prestasi kelulusan 100 %. Pada tahun 2006, dari 159 siswa, tidak satupun yang dinyatakan tidak lulus UAN maupun UAM. Selanjutnya pada tahun 2007 MANU Limpung meluluskan 100 % siswanya yang mengikuti UAN maupun UAM dengan jumlah 203 siswa. Sebaliknya pada tahun 2008, dari 241 siswanya yang mengikuti UAN dan UAM tertinggal hanya 2 siswa saja.
Selain persaingan melalui jalur akademis, jalur yang dianggap cukup jitu (jalur TOL) untuk mengantar MANU Limpung ke posisi bagus di tingkat Propinsi adalah melalui jalur prestasi non akademis antara lain:

1.Gugus Depan Tergiat II se-Kwartir Cabang Batang Tahun 2002
2.Juara I Tennis Meja HUT RI ke-57 Kecamatan Limpung Tahun 2002
3.Juara II Lomba Karnaval Tingkat Kecamatan Limpung Tahun 2002
4.Juara III Lomba Marching Band Piala Bupati Batang Tingkat Pelajar Tahun 2003
5.Gugus Depan Tergiat I se-Kwartir Cabang Batang Tahun 2004 dan 2005
6.Juara II Lomba Marching Band Bupati Batang Cup II Tingkat Pelajar/Umum Tahun 2005
7.Juara I Bola Volly Putra-putri Tingkat Kecamatan Tahun 2006
8.Juara I Bola Volly Putri Popda Kabupaten Batang Tahun 2006
9.Juara II Bola Volly Putra Popda Kabupaten Batang Tahun 2006
10.Juara I MTQ Pelajar Tingkat Kabupaten Tahun 2006
11.Juara II Lomba Marching Band Limpung Artha Cup Tahun 2007
12.Juara III Bola Volly Putri Porseni MA Jawa Tengah di Banyumas Tahun 2007
13.Juara I Bola Volly Putri Popda Kabupaten Batang Tahun 2008
14.Juara II Bola Volly Putra Popda Kabupaten Batang Tahun 2008
15.Juara I Pencak Silat Putra Popda Kabupaten Batang Tahun 2008
16.Juara I Karate Putri Popda Kabupaten Batang Tahun 2008
17.Juara II Napak Tilas Perjuangan Tahun 2008, dll

Selanjutnya, MANU Limpung tidak menutup mata bahwa seluruh rangkaian prestasi tersebut juga merupakan kerja bareng MANU Limpung dengan berbagai instansi swasta maupun negeri di wilayah Kabupaten Batang antara lain:
1.BRI Cabang Batang
2.BPR Limpung Arta
3.Telkomsel Grapari Tegal
4.TELKOM Kandatel Pekalongan
5.PO Dewi Sri
6.Koperasi simpan pinjam “Annajah”, dll

Adapun dukungan dari instansi tersebut adalah dukungan pendidikan dalam bentuk pemberian bantuan siswa berprestasi, peningkatan kualitas kegiatan ekstra kurikuler dan bantuan penambahan sarana/prasarana pembelajaran.